Вам нужно в том подразделении ГИМС, где получали судовой билет, написать заявление об исключении Вашего маломерного судна из реестра маломерных судов, по причине того, что оно не подлежит государственной регистрации.
Заключить ДКП - в ваших обоюдных интересах. Причем больше заинтересован должен быть покупатель. Много бывает случаев, когда нужно подтвердить право собственности на лодку, даже если она "нерегистрат".
После снятия лодки с учета никаких налогов Вы платить за неё не будете.